Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACTA2P62736 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTA2P62736 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms