Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVFC1P60507 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVFC1P60507 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms