Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EEFSECP57772 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EEFSECP57772 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms