Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK4P57078 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms