Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RWDD2BP57060 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms