Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX9P55771 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX9P55771 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX9P55771 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX9P55771 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX9P55771 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX9P55771 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX9P55771 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX9P55771 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX9P55771 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX9P55771 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX9P55771 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX9P55771 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX9P55771 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX9P55771 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX9P55771 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX9P55771 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX9P55771 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX9P55771 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms