Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH8P55286 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDH8P55286 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDH8P55286 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDH8P55286 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms