Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4P55056 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4P55056 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC4P55056 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC4P55056 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms