Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMTNP53814 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMTNP53814 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMTNP53814 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMTNP53814 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNP53814 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNP53814 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNP53814 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms