Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA4P52798 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms