Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SMARCA4P51532 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SMARCA4P51532 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms