Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN2P49810 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN2P49810 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN2P49810 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN2P49810 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN2P49810 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN2P49810 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN2P49810 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSEN2P49810 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms