Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSEN1P49768 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSEN1P49768 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms