Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMUP48645 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMUP48645 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMUP48645 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms