Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms