Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSSP48449 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSSP48449 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSSP48449 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSSP48449 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSSP48449 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSSP48449 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSSP48449 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSSP48449 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSSP48449 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSSP48449 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSSP48449 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSSP48449 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSSP48449 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSSP48449 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSSP48449 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms