Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIP4K2AP48426 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms