Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ME1P48163 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ME1P48163 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ME1P48163 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ME1P48163 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ME1P48163 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ME1P48163 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ME1P48163 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ME1P48163 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ME1P48163 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ME1P48163 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ME1P48163 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms