Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms