Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPD2P43304 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPD2P43304 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPD2P43304 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPD2P43304 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPD2P43304 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPD2P43304 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPD2P43304 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPD2P43304 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPD2P43304 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPD2P43304 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPD2P43304 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms