Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL35P42766 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL35P42766 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL35P42766 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL35P42766 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL35P42766 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms