Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECI1P42126 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECI1P42126 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECI1P42126 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECI1P42126 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms