Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX1P40424 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PBX1P40424 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX1P40424 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PBX1P40424 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX1P40424 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms