Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTRLP40313 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTRLP40313 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTRLP40313 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTRLP40313 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms