Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCN1P35523 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLCN1P35523 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms