Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKBRP32239 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKBRP32239 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKBRP32239 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKBRP32239 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKBRP32239 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms