Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L1CAMP32004 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1CAMP32004 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms