Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND3P30281 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND3P30281 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND3P30281 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND3P30281 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND3P30281 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCND3P30281 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCND3P30281 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCND3P30281 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCND3P30281 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCND3P30281 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCND3P30281 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCND3P30281 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms