Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA1P29973 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms