Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTGFP29279 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTGFP29279 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTGFP29279 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTGFP29279 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTGFP29279 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTGFP29279 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTGFP29279 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTGFP29279 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTGFP29279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTGFP29279 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTGFP29279 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms