Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK1P29120 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK1P29120 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms