Protein–RNA interactions for Protein: P28068

HLA-DMB, HLA class II histocompatibility antigen, DM beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMBP28068 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMBP28068 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DMBP28068 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms