Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
DNMT1P26358 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DNMT1P26358 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DNMT1P26358 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
DNMT1P26358 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms