Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCHP24723 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCHP24723 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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