Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5F1P24539 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5F1P24539 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms