Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 YIF1A-204ENST00000431556 619 ntTSL 215.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CTDNEP1-211ENST00000575783 876 ntTSL 515.17■□□□□ 0.025e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNTTIP2-203ENST00000460191 3084 ntTSL 214.35□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-209ENST00000535561 551 ntTSL 314.31□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UQCC2-202ENST00000374231 509 ntTSL 314.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-206ENST00000558840 554 ntTSL 413.98□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-208ENST00000567027 1353 ntTSL 213.4□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-211ENST00000560063 1355 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-209ENST00000562200 885 ntTSL 213.27□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-208ENST00000452206 1059 ntTSL 512.78□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-207ENST00000586588 3094 ntTSL 212.72□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ERI3-204ENST00000456170 1103 ntTSL 512.67□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UQCC2-203ENST00000606961 4365 nt12.55□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 412.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CDC123-207ENST00000467016 296 ntTSL 212.31□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-212ENST00000560569 1036 ntTSL 512.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-208ENST00000535459 581 ntTSL 211.94□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 311.89□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-203ENST00000482252 2953 ntTSL 210.84□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-211ENST00000564415 3000 ntTSL 510.71□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 AKR1C1-204ENST00000476100 713 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.36□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-210ENST00000537657 507 ntTSL 210.23□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-206ENST00000447069 557 ntTSL 410.22□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-204ENST00000410110 1075 ntTSL 510.16□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-207ENST00000530314 3488 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ERI3-202ENST00000372259 1332 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-212ENST00000464483 530 ntTSL 29.51□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-209ENST00000559848 756 ntTSL 39.37□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UBE2N-205ENST00000550657 3018 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNTTIP2-206ENST00000496672 811 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -11e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UBE2N-206ENST00000552442 607 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-208ENST00000559700 948 ntTSL 28.52□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UBE2N-203ENST00000549490 676 ntTSL 28.26□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 HEXA-213ENST00000568777 6909 ntTSL 58.13□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 POLR2G-208ENST00000533442 388 ntTSL 38.06□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNTTIP2-201ENST00000359208 2199 ntTSL 27.82□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNTTIP2-207ENST00000528680 499 ntTSL 37.7□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-207ENST00000450637 578 ntTSL 47.03□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PBK-204ENST00000524266 819 ntTSL 56.78□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 COG4-208ENST00000534772 647 ntTSL 36.64□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-213ENST00000560610 832 ntTSL 56.54□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 BZW1-205ENST00000419090 557 ntTSL 36.03□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CDC123-205ENST00000442050 564 ntTSL 55.51□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 CDC23-204ENST00000471692 1104 ntTSL 55.43□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.552e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 MAPK1IP1L-202ENST00000553976 517 ntTSL 34.56□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 SOD2-213ENST00000541573 573 ntTSL 44.15□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PBK-202ENST00000521226 748 ntTSL 32.01□□□□□ -2.091e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.191e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.172e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 EPCAM-206ENST00000490733 752 ntTSL 34.79□□□□□ -1.647e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 DAG1-211ENST00000461492 580 ntTSL 318.67■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PHGDH-214ENST00000641314 1558 nt17.42■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 27.8
RPS3P23396 PSMA4-211ENST00000559154 637 ntTSL 24.42□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 27.8
RPS3P23396 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 45.32□□□□□ -1.565e-9■■■■■ 27.8
RPS3P23396 WBP2-210ENST00000589241 557 ntTSL 211.46□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 27.8
RPS3P23396 GSN-213ENST00000483960 802 ntTSL 311.1□□□□□ -0.634e-16■■■■■ 27.8
RPS3P23396 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 416.04■□□□□ 0.169e-22■■■■■ 27.7
RPS3P23396 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CCDC117-206ENST00000453543 1026 ntTSL 229.1■■■□□ 2.252e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CCDC117-204ENST00000444523 463 ntTSL 423.26■■□□□ 1.312e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 FADS1-208ENST00000473263 574 ntTSL 420.31■□□□□ 0.842e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-207ENST00000589755 793 ntTSL 220.17■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CALM1-207ENST00000553964 2670 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.592e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 518.5■□□□□ 0.552e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-208ENST00000590632 601 ntTSL 217.67■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-204ENST00000589331 537 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-205ENST00000589625 587 ntTSL 215.32■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 27.7
RPS3P23396 CDC37-209ENST00000591248 1377 ntTSL 514.97□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 248.3 ms