Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP8P22894 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP8P22894 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP8P22894 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP8P22894 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP8P22894 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP8P22894 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP8P22894 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP8P22894 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP8P22894 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP8P22894 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP8P22894 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP8P22894 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP8P22894 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP8P22894 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP8P22894 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP8P22894 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms