Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR3P22607 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms