Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT1P21579 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT1P21579 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT1P21579 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT1P21579 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT1P21579 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT1P21579 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT1P21579 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT1P21579 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT1P21579 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms