Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNB1P20700 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms