Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRHP20396 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRHP20396 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRHP20396 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRHP20396 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRHP20396 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRHP20396 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRHP20396 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRHP20396 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TRHP20396 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRHP20396 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRHP20396 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRHP20396 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRHP20396 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRHP20396 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRHP20396 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRHP20396 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRHP20396 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRHP20396 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRHP20396 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRHP20396 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRHP20396 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRHP20396 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRHP20396 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms