Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGCP20142 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGCP20142 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGCP20142 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGCP20142 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGCP20142 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGCP20142 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGCP20142 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGCP20142 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PGCP20142 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGCP20142 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGCP20142 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms