Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CXCL2P19875 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms