Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATF1P18846 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF1P18846 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF1P18846 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF1P18846 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATF1P18846 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms