Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RCC1P18754 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RCC1P18754 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RCC1P18754 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RCC1P18754 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCC1P18754 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCC1P18754 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCC1P18754 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RCC1P18754 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RCC1P18754 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms