Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL17P18621 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL17P18621 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL17P18621 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL17P18621 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL17P18621 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL17P18621 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL17P18621 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL17P18621 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL17P18621 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL17P18621 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms