Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN1P18031 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN1P18031 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms