Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VEGFAP15692 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VEGFAP15692 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms