Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC130P13994 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC130P13994 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms