Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT13P13646 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT13P13646 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT13P13646 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT13P13646 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT13P13646 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT13P13646 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT13P13646 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT13P13646 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms